如何應對細胞株系開發數據挑戰

細胞株開發是眾多具有重大數據挑戰的工作流程之一。與任何篩選過程一樣，樣本通量帶來了數據量的挑戰。當使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數據時，這就變得更加具有挑戰性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數據，而且整個過程可能會延長數月。在整個過程中，必須對數據進行追蹤，以確保進入生產的任何細胞株都有必要的歷史數據（例如單克隆性的證明），并且為了報告需要，所有的數據都可以被方便地訪問。在這里，我們將描述在Biomek i7工作站（圖1）上自動化細胞株開發如何克服與此工作流程相關的許多數據挑戰。

圖1：Biomek i7工作站與三方設備整合一起被用于自動化細胞株開發工作流程。

作為液體轉移步驟的一部分，Biomek軟件會自動移動數據，因此數據可以隨著樣本移動而并行移動（圖4）。同時，數據也可以存儲在DART數據庫中，未來任何時候掃描孔板條碼時，相應的數據都會被自動檢索出來。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接（圖4）——在諸如細胞株開發這樣的長時間工作流程中，這是一個關鍵組件。

圖3：自動化數據處理示意圖。

除開存儲和利用數據，DART數據庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進行快速可視化，可通過Chrome瀏覽器直接實時查看（圖6A），同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。

圖6：DART數據查看和報告。

在任何實驗中產生的數據使實驗有價值。數據處理中的任何錯誤都可能消除這個價值，甚至可能將研究進程推向錯誤的方向。對于像細胞株開發這樣長達數月的工作流程，數據丟失或錯誤的風險更大，因此，確保數據完整性的工具至關重要。Biomek和DART軟件通過使數據完整性過程自動化且易于獲取，可以為細胞株開發過程提供真正的價值。

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*以上內容涉及設備僅適用于科研和工業，不用于臨床診斷。